Цитата: Договор на поставку товаров (уже готовых).
Это хорошо, что такой договор есть.
Цитата: но я же не могу согласно этого договора выставить им акт на оказание услуг (тем более "освоение новой номенклатурной группы"... как выписали нам наши поставщики)
Нет, такого акта не требуется.
Цитата: как я поняла там уже нужен агентский договор
И агентский договор не нужен.
Делаете Соглашение о расторжении договора поставки. И в этом соглашении указываете, что на подготовку к поставке вами были осуществлены расходы: такие-то и в таком размере, в том числе НДС., которые поставщик обязуется компенсировать.
И всё. Выставляете счет и получаете деньги.
Выставляете счет-фактуру.
Отражаете эти деньги в доходе, затраты по подготовке - в расходы.
Успехов!